TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析

TMT™ 試薬を用いて網羅的なタンパク質の発現解析を行います。

サービス概要

iTRAQ®試薬あるいはTMT™試薬を用いた解析では、標識したサンプルを質量分析計で分析することで、網羅的にタンパク質の同定を行うと同時に、比較定量が可能な数値データを取得する事ができます。

最大で18種類のサンプルを同時に分析することができるため、薬剤投与からのタイムコースや、病態変化に伴うタンパク質の発現変動解析などに応用することが可能です。

例えば、iTRAQ®試薬の場合では、合計の質量が305となる「バランス領域」と「レポーター領域」を持ちます。
MS/MSが行われた際に、タンパク質に結合したiTRAQ®試薬のレポーター領域が切断されます。このレポーター領域は、安定同位体が組み込まれており、化学的な構造は同じですが、分子量の異なる化合物として合成されています。

各サンプルから切断されるレポーター領域が異なる質量で検出されることを利用して、定量データが取得できます(TMT™試薬でも類似の原理に基づき、定量データを取得します)。

フローチャートでは、8種類のサンプルをiTRAQ®試薬を用いて分析する場合について説明しています。まず、それぞれのサンプルをトリプシンを用いてペプチドに断片化し、iTRAQ®試薬で標識します。この例の場合、サンプル1由来の全てのペプチドは、113のレポーター領域を持つ試薬で標識されています。同様に、サンプル2は114,サンプル3は115の試薬で標識されています。

MS/MS分析を行うと、レポーター領域由来の113から121のピークが検出されます。このピークの強度の比から定量を行います。同時に、検出されたその他のピークからタンパク質同定を実施します。
このようにして、複数のサンプルに、どのようなタンパク質がどのような量比で含まれるかを解析します。

弊社では、これまでに様々な検体を取り扱ってきた実績があります。各種組織、培養上清等の希薄なタンパク質溶液、血清・血漿などの前処理にひと手間かかるサンプル、植物など夾雑物の多いサンプルなど、それぞれに前処理のコツがあります。それらのノウハウを活かして、ユーザー様それぞれの検体に最適な分析・解析を行います。

こんな人にオススメ

  • 病態・薬剤投与で変動するタンパク質を探索されている方
  • 一度の分析で、網羅的なタンパク質同定と定量比較を行いたい

仕様

必要サンプル量タンパク質 50μg 以上
推奨サンプル形態組織、細胞、血清、培養上清、抽出液 等
※ Tris 等アミン系試薬は標識を阻害するため使用しないでください。
※ 溶液量は、数百 μL 程度以内でご提供下さい。
※ 組織片の場合は 数mm角 程度、
  培養細胞の場合は細胞数 106 個 程度を目安にご準備ください。
納期サンプルをお受け取りした日から、1.5~2か月程度
※ サンプルを受け取るタイミングによっては、前後する場合があります
サービス内容● サンプル前処理
  ┗ 組織等からのタンパク質抽出・精製
  ┗ サンプルQC (タンパク質定量・SDS-PAGE)
  ┗ 酵素消化・ラベル化・分画・精製
● LC-MS/MS分析
   質量分析計: Orbitrap Exploris 480 (Thermo Fisher Scientific)
   HPLC : Vanquish Neo (Thermo Fisher Scientific)
● データ解析
  ┗ 同定タンパク質リスト
  ┗ 比較定量値リスト

ご依頼に必要な情報

  • 生物種
  • サンプルの由来となる組織、細胞
  • ご提供サンプルの状態(組織、細胞、タンパク質抽出物)
  • タンパク質抽出物の場合は、溶液組成

価格

商品コード商品名内容販売価格(税別)
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(2サンプル) 1,100,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(3サンプル) 1,100,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(4サンプル) 1,100,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(5サンプル) 1,100,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(6サンプル) 1,320,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(7サンプル) 1,540,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(8サンプル) 1,760,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析(9サンプル) 1,980,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析10サンプル) 2,200,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析11サンプル) 2,420,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析12サンプル) 2,640,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析13サンプル) 2,860,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析14サンプル) 3,080,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析15サンプル) 3,300,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析16サンプル) 3,520,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析17サンプル) 3,740,000円
 TMT™ 試薬を用いた相対定量プロテオーム解析18サンプル) 3,960,000円

参考資料

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