マイクロアレイとは、数万個の遺伝子のmRNAを同時に測定する手法です。 具体的には、基盤上に数万種類のDNA（プローブ）が高密度に固定されており、 蛍光標識されたサンプル由来のRNAをプローブにハイブリダイズさせることで、プローブに対応する遺伝子の発現を検出します。 また、マイクロアレイ解析やRNAシーケンスによって、ターゲット遺伝子が絞り込まれた場合には、 リアルタイムPCR法を用いた遺伝子発現解析が有用です。